ทั้งน้ำมันตับปลาค็อดและน้ำมันปลามี EPA และ DHA ซึ่ง EPA หรือ Eicosapentaenoic acid ช่วยลดระดับคอเลสเตอรอลและไตรกลีเซอไรด์ และช่วยเพิ่ม HDL ในเลือด ลดความเสี่ยงของการเกิดภาวะหลอดเลือดอุดตัน อันเป็นสาเหตุของโรคหัวใจและหลอดเลือด ส่วน DHA หรือ Docosahexaenoic acid เป็นกรดไขมันที่จำเป็นต่อสมองและการเรียนรู้

น้ำมันตับปลาค็อด แตกต่างจากน้ำมันปลาตรงที่มีวิตามินเอและดีในระดับสูง มีคุณสมบัติช่วยลดการอักเสบของร่างกายของเรา บรรเทาอาการปวดจากข้ออักเสบ ความวิตกกังวล ภาวะซึมเศร้า แลดความดันโลหิตและไตรกลีเซอไรด์ ช่วยเพิ่มคอเลสเตอรอลที่ดี ป้องกันการสะสมของหินปูนบริเวณผนังหลอดเลือดแดง และเพิ่มภูมิคุ้มกันและมวลกระดูก

หากต้องการรับประทานผลิตภัณฑ์เสริมอาหารน้ำมันตับปลาค็อดและน้ำมันปลา ควรเลือกรับประทานเพียงอย่างใดอย่างหนึ่งเท่านั้น เพราะอาจทำให้บริโภคกรดไขมันโอเมก้า 3 มากเกินไปจนอาจทำให้เกิดผลข้างเคียง การรับประทานน้ำมันตับปลาค็อดถือว่าไม่เป็นอันตราย แต่อาจทําให้เกิดผลข้างเคียง เช่น แสบร้อนกลางหน้าอก ท้องอืด เลือดกําเดาไหล และเลือดแข็งตัวได้ช้า

สำหรับสตรีมีครรภ์ไม่ควรรับประทานผลิตภัณฑ์เสริมอาหารน้ำมันตับปลาค็อด เนื่องจากมีวิตามิน เอ ในระดับสูงที่อาจเป็นอันตรายต่อทารกในครรภ์ ก่อนรับประทานผลิตภัณฑ์เสริมอาหารใด ๆ ควรปรึกษาแพทย์โดยเฉพาะอย่างยิ่งผู้ที่เป็นโรคหัวใจหรือแพ้อาหารทะเล เช่น ปลาและสัตว์เปลือกแข็ง